Siamo sicuri che il formato wav non abbia dei tag anche lui?
Ad ogni modo tutto sta nel rinominare i file correttamente, se li rinomini in 01, 02, 03, 04... non dovrebbe avere problemi nel metterli nell'ordine giusto..
Mi sembra molto strano che copiandoli direttamente nel pendrive vadano a caso, mentre copiandoli da cd (pur mantenendo il formato) li legga nell'ordine giusto. Mi viene da pensare che il problema stia più nel tuo pc che non nella tua auto..
Poi c'è sempre la solita domanda scontata, ma che sono obbligato a farti: non è che per sbaglio, inavvertitamente, ti è capitato di attivare la riproduzione casuale?
Ti ricordo, poi, sempre, che a scanso di equivoci, se hai delle sequenze numerate, conviene mettere degli zeri davanti ai numeri piccoli, in modo che abbiano tutti lo stesso numero di cifre. Se hai 100 canzoni, le prime dovresti numerarle 001, 002, 003 e così via, mentre se ne hai 99 o meno, basta solo 01, 02, 03.. altrimenti dopo la canzone 1 può capitare, a seconda delle logiche del lettore, che legga la canzone 10 e non la 2.